2006年5月29日，证监会发布《保荐人尽职调查工作准则》，第一次明确规定了保荐代表人尽职调查工作的内容和范围。由于证监会本质上是希望保荐代表人成为证券发行的总负责人，因此该文件的规定十分详尽，保荐责任的边界从此开始模糊，保荐代表人成为对整个证券发行负总责的人。尽职之“尽”，实际是“无穷尽”的意思。姚刚副主席在保荐代表人培训课上明确提出：如果发行人将来出了问题，再倒查底稿，保荐代表人很难证明自己是否尽职了。所以最关键的是认真挑选靠谱的企业，靠谱的老板。
由于新股恢复发行，各券商的投资银行业务在经过了两年的低迷后重新活跃起来，IPO业务和再融资业务都需要保荐代表人签字才可以上报，而每两个保荐代表人只能同时签报一个项目，与2004年很多券商为了获得保荐资格而挖角不同，因项目需要而对保荐代表人需求量的迅速增加，保代身价出现普遍性飙升。业内的观点是：做一个项目可以挣2000万，挖一个保代才要30万转会费，加上年薪50万，挖来俩保代一年成本也就200万而已，这事划得来！
2007年——重量级罚单出现，市场依然火爆
2007年1月18日，证监会在其官网发布《对财富证券有限责任公司及其保荐代表人采取暂不受理推荐的监管措施》，第一单被暂停保荐机构资格的处罚出现。“2006年12月7日，财富证券在向深交所报送《湖南南岭民用爆破器材股份有限公司股票发行基本情况表》电子表格时，将发行价格9.38元/股错误地填写为9.36元/股，深交所据此在新股申购系统中将南岭民用首次公开A股的限价设定为9.36元。由于深交所交易系统显示的发行价格与发行公告价格不一致，导致原定于12月8日的发行暂停，投资者对南岭民爆的所有申购无效，不得不于12月11日重新进行申购。中国证监会于2006年12月9日起三个月内不再受理财富证券有限责任公司的推荐；六个月内不受理财富证券有限责任公司保荐代表人唐劲松、黄崇春负责推荐的项目。”
2007年3月30日，证监会在其官网上公告“鉴于光大证券的周皓、原天一证券的杜坤勇和中金公司的连涟没有参加2006年度保荐代表人业务培训，根据《证券发行上市保荐制度暂行办法》和《关于进一步做好〈证券发行上市保荐制度暂行办法〉实施工作的通知》的规定，周皓、杜坤勇、连涟已从保荐代表人名单中去除。”这是第一次有人因未参加保荐代表人培训而被取消保荐代表人资格。
2007年度发行新股118只（第一次发行新股家数超过百家）；沪市日成交量过千亿成为常态；平安证券、国信证券等一批券商脱颖而出；2007年10月16日沪指创下6124.04点的历史最高点；中国石油2007年10月22日刊登招股意向书，10月26日发行，发行价格16.7元，募集资金668亿元，网下冻结资金7992亿元，网上冻结资金25786亿元；11月5日中石油上市，开盘价48.6元，涨幅高达191%，市场之疯狂可见一斑。直到今天，还有很多资本市场的参与者在怀念那个疯狂的2007年。
由于IPO和再融资业务双重火爆，各投行开始大肆招人；各投行除了大肆招收应届毕业生外，在保荐代表人高薪的诱惑下，大量其他行业的人员也带着暴富的心理进入投行。投行队伍实现了第一次大扩容，截至到2013年底，在全体投行人中，2007年之前进入投行的比例恐怕不足半数，大多数投行人的投行职业生涯是从2007年以后才开始的。
2008年——泡沫破裂，IPO暂停等
2008年7月9日，证监会在其官网公告“首创证券保荐代表人刘晓山与日信证券保荐代表人雷茂（于2008年5月由首创证券转会日信证券）保荐的湘潭电化自2007年4月上市以来，公司经营业绩呈现出大幅下滑的态势：公司2007年一季度、半年度、前三季度以及全年的净利润分别较上年同期下降45.04%、48.95%、98.57%和89.54%，2007年主营业务利润较上年下滑63.30%。我会决定，于2008年6月27日起三个月内不受理保荐代表人刘晓山与雷茂负责推荐的项目。”这是第一单因上市公司业绩下滑导致保荐代表人被暂停资格的处罚。
2008年8月，证监会修订《证券发行上市保荐业务管理办法》，将保荐机构需要拥有的保荐代表人数量从2人提高到4人，并要求“从业人员不少于35人，其中最近3年从事保荐相关业务的人员不少于20人；”保荐机构条件的提高，又进一步提升了保荐代表人的稀缺性。
在2007年10月16日创下6124.04点的历史最高点后，沪综指一路下滑，至2008年9月16日跌破了2000点，11个月的时间大盘下跌了超过67%，大面积的新股破发让市场对IPO的愤怒声浪越来越高，在大盘跌破2000点后，在华昌化工发行之后，监管层被迫再次暂停IPO。
IPO暂停后，由于部分券商为了火爆的IPO和再融资招进了大量投行人员，突然的IPO暂停使得投行第一次感受到产能过剩，对于很多投行人来说，第一个寒冬来临了，年底的时候已经有不少券商明里暗里的开始了裁员。
2008年11月20日，证券业协会发布《2008年度保荐代表人胜任能力考试公告》，值得注意的是，2008年的考试公告中规定的考试报名条件为“从事证券发行承销、收购兼并、固定收益等投资银行相关业务两年以上，且已取得证券从业资格的人员均可报名参加此次考试。”这多出来的“相关业务”4个字，恐是因为2007年投行大扩招时有一定量的会计师和律师加入了投行队伍，而考试内容和证监会审核也确实都是以法律和财务为主，各投行为了能够尽快让这些“优质”产能尽快成为“保代”产能，可能对监管部门有些游说。而当这“相关业务”的许可闸门一开，又在未来几年带动了更多的会计师和律师加入投行。以至于再往后，一个项目组同时配备着持有CPA牌照和持有律师牌照的成员成为了常见现象。由于多了“相关业务”这4个字，2008年的考试报名人数增加到3688人，创了历史记录！
2008年12月31日，在考试已经结束后，如2004年第二次考试一样，证券业协会宣布了新的合格规则“保荐代表人胜任能力考试合格线为总分120分，单科不低于50分。”考试合格线的降低，直接的结果是当年考试通过人数为642人，也创了历史记录！在此之前，总的考过人数也只有1588人，这次考试出现了大放水！保代资格贬值化只是时间问题了。
2009年——IPO发行定价改革，创业板
2009年5月22日，在沪综指从新一轮的地点1664点上涨1000点后，证监会发布了《关于进一步改革和完善新股发行体制的指导意见（征求意见稿）》，启动新股发行体制改革。新股定价进一步市场化，淡化对新股定价的窗口指导，培育市场约束机制。这次改革给中国资本市场带来了巨大的变化和影响。
2009年6月10日，证监会正式发布了《关于进一步改革和完善新股发行体制的指导意见》，之后桂林三金刊登招股意向书开始招股，并于2009年6月29日成功发行，IPO再次恢复发行。桂林三金的发行市盈率是32.89倍，多年来首次突破30倍市盈率的天花板，成为重要信号，之后主板的中国建筑发行市盈率突破50倍、创业板的鼎汉技术突破80倍、阳普医疗突破100倍、新研股份更是创造了150倍的神话！汤臣倍健发行价超过100元，海普瑞更是达到了148元的历史最高发行价！
本轮新股发行体制改革后，各券商的市场部逐步得到重视，承销费用与募集资金总额挂钩开始普遍出现，券商投行承销收入大幅上涨，投行从业人员迎来最黄金的时期。
2009年3月31日，证监会正式发布《首次公开发行股票并在创业板上市管理暂行办法》，创业板的开启正式提上日程。7月26日开始受理创业板IPO申请。仅仅不足2个月后，9月13日证监会发出创业板发审委2009年第1-4次工作会议公告，9月17日审核特锐德等7家公司首发申请（不到2个月的IPO审核周期是证监会历史上绝无仅有的，体现了证监会的超高效率）；9月21日，特锐德等10家公司刊登招股意向书开始招股；9月25日完成发行，所有公司均发现拿了大笔的、从来没想到过有这么多的钱；10月30日，首批28家创业板公司成功上市，创业板正式开板，首批28家上市首日遭到爆炒，在发行市盈率已经大多高达50倍以上的情况下，涨幅超过100%的依然比比皆是。创业板有了一个疯狂的开始。